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长期以来，地理科学学院在长白山景观生态与气候变化、湿地科学、区域经济学、城市地理与城乡规划、地理信息系统科学等多个领域开展了卓有成效的研究工作，并逐渐形成特色。

学院拥有国家环境保护湿地生态和植被恢复重点实验室（环境保护部）、植被生态科学教育部重点实验室、吉林省生态恢复与生态系统管理实验室（省部共建国家重点实验室）、中国东北资源与环境吉林省高等学校重点实验室（吉林省重点实验室）、吉林省地理科学基础实验教学示范中心等科研平台。学院下设中国东北研究院、泥炭沼泽研究所、城乡规划研究设计院、旅游研究所、土地资源管理研究所等研究机构。另有中国地理学会东北地区工作站、国际泥炭学会中国国家委员会、中国腐殖酸工业协会泥炭分会、吉林省泥炭学会等学术挂靠机构。

学院目前共有在研纵向项目80余项，横向合同30余项，其中国家科技计划课题1项、子课题2项，国家自然科学基金重点项目1项、面上项目21项、青年基金17项，科技部专项2项，国家社科基金项目2项，教育部人文社会科学研究项目2项。

2012年至今，地理科学学院作为第一单位发表了近百篇SCI检索论文、3篇SSCI检索论文以及10余篇A类论文，其中扩展版ESI高被引论文1篇；出版著作24本，其中“十二五”国家级规划教材三本；转化专利三项；获得国家级及省级科研奖励各一项。